Parte I: Ecología y evolución. Ecología microbiana: desarrollo histórico. Evolución microbiana y biodiversidad.
Parte II: Interacciones entre poblaciones. Interacciones entre poblaciones microbianas. Interacciones entre microorganismos y plantas. Interacciones entre microorganismos y animales. 
Parte III: Comunidades y ecosistemas microbianos. Desarrollo de las comunidades microbianas. Ecología cuantitativa: número, biomasa y actividad. Ecología fisiológica de los microorganismos: adaptaciones a las condiciones ambientales. Microorganismos en sus hábitats naturales: microbiología del aire, del agua y del suelo.
Parte IV: Ciclos biogeoquímicos. Ciclos biogeoquímicos: carbono, hidrógeno y oxígeno. Ciclos biogeoquímicos: nitrógeno, azufre, fósforo, hierro y otros elementos.
Parte V: Aspectos biotecnólogicos de la ecología microbiana. Aspectos ecológicos en el control del biodeterioro y en la gestión de suelos, residuos y agua. Interacciones microbianas con contaminantes xenobióticos e inorgánicos. Ensayos de biodegradabilidad y seguimiento de la biorremediación de contaminantes xenobióticos. Microorganismos en la recuperación de minerales y energía y en la producción de combustible y biomasa. Control microbiano de plagas y de poblaciones patógenas. 
Glosario.

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